Ο στρατός του Μάλι έχει διαπράξει αρκετές παραβιάσεις ανθρωπίνων δικαιωμάτων και διεθνούς ανθρωπιστικού δικαίου κατά τη διάρκεια της συνεχιζόμενης διαμάχης εναντίον ένοπλων ομάδων, μεταξύ των οποίων εξώδικες εκτελέσεις πολιτών, σύμφωνα με μαρτυρίες που συνέλεξε η Διεθνής Αμνηστία κατά τη διάρκεια μιας δεκαήμερης αποστολής στο Μάλι.
Στις 5 Φεβρουαρίου 2013, έπειτα από επιτόπια έρευνα στο Μάλι, η Διεθνής Αμνησία δημοσίευσε την πρώτη της έρευνα: “Μάλι : πρώτη εκτίμηση της κατάστασης ανθρωπίνων δικαιωμάτων έπειτα από τρεις εβδομάδες μαχών [1]” [fr]. Η δημοσίευση υπογραμμίζει [2] [fr] ότι πολίτες απειλούνται από όλες τις πλευρές που συμμετέχουν στις διαμάχες.